Di Papua dan Provinsi Papua Barat, SEKALA telah bekerja untuk Satuan Tugas REDD+ dan Satuan Tugas Pembangunan Ekonomi Rendah Karbon untuk menyediakan data dasar dan peta kadaster bagi kedua provinsi ini. SEKALA juga bekerja untuk Lucile Packard Foundation di Kabupaten Merauke untuk mendukung pembangunan hijau (Kabupaten Hijau) di Tingkat Kabupaten dan Provinsi; dan United Kingdom Climate Change Unit (UKCCU) Program Papua untuk mengumpulkan dan menganalisis data spasial untuk Provinsi Papua.

SEKALA juga memimpin konsorsium dengan Yayasan Dukungan Masyarakat Sipil Papua - (PCSSF) dan Nordic Consulting Group (NCG) untuk melaksanakan Penilaian Lingkungan Strategis (SEA) untuk perencanaan tata ruang di provinsi Papua. SEA menilai konsekuensi ekonomi, sosial dan lingkungan dari skenario pengembangan yang berbeda dan memberikan informasi spasial yang lebih baik kepada pemerintah provinsi Papua. Sejumlah besar data spasial dan statistik dikumpulkan dan dianalisis untuk proyek ini sehingga rekomendasi perencanaan tata ruang dapat diberikan kepada pemerintah Papua dan Papua Barat.

SEKALA juga secara berkala memberikan dukungan teknis kepada organisasi lokal yang melakukan pemetaan komunitas di Provinsi Papua dan Papua Barat, serta memberikan pelatihan tentang pemetaan masyarakat, perencanaan tata ruang, SIG dan penginderaan jarak jauh untuk organisasi-organisasi ini. Selain itu, SEKALA juga telah mengembangkan analisis ancaman dinamis untuk Papua, yang menyoroti ancaman sosio-ekonomi masa lalu dan saat ini terhadap hutan Papua.